README.md

MM-6mAPred

• tans_pro.py 是MM-6mAPred的实现，其中包含交叉验证和独立测试。

序列必须等长 !!！

参数设置

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参数	取值
-trainfasta	xxx.fasta
-trainpos	正例数
-trainneg	反例数
-testfasta	xxx.fasta
-testpos	正例数
-testneg	反例数
-cv	交叉验证折数默认10

必须设置的参数

• -trainfasta
• -trainpos
• -trainneg

使用方法

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• 交叉验证用法：

python tans_pro.py  -trainfasta XXX.fasta -trainpos posnum -trainneg negnum -cv cv

• 独立测试用法：

python tans_pro.py  -trainfasta XXX.fasta -trainpos posnum -trainneg negnum -testfasta XXX.fasta -testpos num -testneg num