probléme due au passage en python 3

[mandiayba]

@rbossy je viens de constater que tes derniéres modifs concernant python3 ont causé des problémes à l'utilisation du script https://github.com/Bibliome/obo-utils/blob/master/obo2obo.py dans pipeline omnicrobe.

J'ai une ontology vide comme résultat quand j'utilise la version actuelle du code avec python2 et une erreur "AttributeError: 'dict' object has no attribute 'itervalues'" quand j'utilise python3

Le dernier commit qui fonctionne pour moi est la suivante 06ae8a1 et c'est avec Python 2.7.15

[mandiayba]

En attendant correction, je me permets d'ajouter une branche sur le dernier commit qui fonctionne https://github.com/Bibliome/obo-utils/tree/python2.5.17-compatible

[rbossy]

@mandiayba

1ce72a9 met tout les scripts compatibles avec Python 3. Dis-moi si ça marche.

[mandiayba]

@rbossy le bug a disparu, le script passe.
Je vais cependant créer une issue dans le wf omnicrobe pour mettre à jour et m'assurer l'ensemble fonctionne.
Je propose de fermer cette issue.